Questa anomalia può portare ad una diminuzione della fertilità o ad una perdita totale se si tratta di criptorchidismo bilaterale. Poiché i testicoli non scendono e rimangono nella cavità addominale o nel canale inguinale, la temperatura in cui sono alloggiati è superiore a quella necessaria per il corretto sviluppo della spermatogenesi, la produzione di spermatozoi. Questo può causare la morte delle cellule germinali e di conseguenza un eiaculato senza sperma o con una concentrazione di sperma alterata. In genere, un intervento chirurgico eseguito in età precoce risolverebbe il problema della fertilità, poiché una volta che i testicoli si sono inseriti nello scroto e rimangono alla giusta temperatura, riprenderanno la loro funzione. È anche noto che la chirurgia precoce può ridurre il rischio di tumori testicolari, soprattutto per quei criptorchidi in cui la posizione dei testicoli è intra-addominale.
